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<p>17년 전 아프리카.</p><p>신의 병사라고 불리는 불사신 병사가 미군에 의해 붙잡혔다.</p><p>세계 최초로 "아인"의 존재가 증명된 순간이었다.</p><p>그 특징은, 불사. 병사, 사고사, 어떤 형태로 사망하든 곧바로 몸은 재생되고 완벽한 상태로 부활한다.</p><p>그것은 그야말로 인류가 꿈꾸던 것이었으며 그 이용가치는 무한하다고 여겨졌다.</p><p>그 후, 아인은 세계에서 46체, 일본에서는 2체가 확인됐다.</p><p>하지만 「죽지 않으면, 알 수 없는」 아인은 그 성질상 발견이 어렵기 때문에 세계에는 더 많은 아인이 있을 것이라고 추정된다.</p><p>남고생 나가이 케이는 하교중 트럭에 치여 사망한다. 하지만 직후 되살아난다.</p><p>국내 3번째 아인으로 판명된 케이는 경찰 및 아인관리위원회 거기다 포상금을 노리는 모든 인간들에게 쫓기는 신세가 된다.</p><p>산속으로 도망친 케이는 소꿉친구 소년 카이토의 도움을 받아 긴급배치된 경찰의 포위망을 돌파해 더 멀리 도주한다.</p><p>같은 시각 일본의 관리하에 있던 2번째 아인 타나카가 "모자"라고 불리는 남자의 도움을 받아 탈주.</p><p>이 자들은 바로 인류를 향한 테러활동을 시작한다.</p><p>아인관리위원회의 책임자 토사키는 나가이 케이의 포획과 아인들이 일으키는 테러행위 진압에 애쓴다.</p><p>그리고, 단서가 될 케이의 여동생 나가이 에리코를 주목한다.</p><p>하지만 그곳엔 이미 인류를 향한 복수를 맹세한 다른 아인과 IBM이라고 불리는 수수께끼의 검은 물체가 침입해있었다...</p>