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<p>유우키 쥬다이는 듀얼 아카데미아의 입학 시험을 치르기 위해 학교로 향하던 중, 전설의 듀얼리스트 무토 유우기를 만나 한 장의 카드를 받게 된다. 그러다 보니 결국 시험장에 늦게 도착하고 만 쥬다이. 시험을 치르게 해 달라고 부탁해 보았지만, 크로노스 교수는 필기 시험 성적도 별로 좋지 못한 쥬다이가 시험을 치는 것은 의미없는 일이라고 잘라 말한다. 결국 상황은 쥬다이와 크로노스 교수의 결투로까지 확대되고, 이윽고 시작된 싸움에서 쥬다이는 크로노스의 레어카드 '앤틱 기어 골렘'에 의한 공격으로 큰 데미지를 입고만다. 곤경에 처한 쥬다이게게 어떤 목소리가 들려오고, 그것이 무토 유우기로부터 받은 카드임을 깨닫는데...</p>